Klaipėdos jūrininkų ligoninės Abdominalinės chirurgijos skyrius užtikrina chirurginę pagalbą visą parą. Atliekamos planinės bei skubios pilvo ertmės organų, odos ir poodžio, skydliaukės operacijos, taip pat endoskopinės virškinamojo trakto operacijos.
Skyriaus tel. (8 46) 491091

Skyriuje gydomos visos arterijų ir venų ligos: aortos ir jos šakų aterosklerotiniai pakitimai, aortos lanko šakų patologija, žarnyną maitinančių arterijų patologija, inkstų arterijų patologija, apatinių ir viršutinių galūnių arterijų ligos.
Skyriaus tel. (8 46) 491056

Skyriuje chirurginiu būdu gydomos išeminė širdies liga, komplikacijos po ūminio širdies infarkto, širdies vožtuvų ligos, krūtinės aortos, perikardo ligos, kai kurios įgimtos širdies ydos suaugusiems ligoniams.
Skyriaus tel. (8 46) 491054

Jūrininkų ligoninės Ginekologijos ir endoskopinės ginekologijos skyriuje yra tiriamos ir gydomos pacientės, kurioms reikalingas konservatyvus arba operacinis gydymas dėl įvairių ginekologinių (dubens uždegiminės liga, menstruacinio ciklo sutrikimai, endometriozė, kiaušidžių augliai, gimdos miomos, gimdos kaklelio patologijos, įgimtos genitalijų ligos, lyties organų slinkimas, šlapimo nelaikymas ir kt.), onkologinių ligų, taip pat dėl ankstyvų nėštumo komplikacijų (persileidimo, nesivystančio ar negimdinio nėštumo).
Skyriaus tel. (8 46) 491082

Anesteziologijos –intensyvios terapijos skyrių (AITS) sudaro du padaliniai: anesteziologijos (operacinė) bei intensyvios terapijos (reanimacijos). Gydytojai anesteziologai atlieka nejautras ginekologijos, kraujagyslių ir abdominalinės chirurgijos skyrių pacientams, yra atsakingi už ankstyvą pooperacinę priežiūrą ir nuskausminimą pooperacinėje palatoje.
Skyriaus tel. (8 46) 491065

Širdies ir kraujagyslių anesteziologijos, intensyvios terapijos ir operacinių poskyris yra Kardiochirurgijos skyriaus dalis. Poskyrį sudaro dvi širdies operacinės ir šešių lovos intensyviosios terapijos palata. Poskyryje dirbantys profesionalai atlieka aukštos kvalifikacijos anestezijas įvairių širdies operacijų ir intervencijų metu.
Poskyrio tel. (8 46) 491049