Skyriuje tiriami ir gydomi pacientai, sergantys ūminiais insultais ir kitomis galvos smegenų kraujagyslių ligomis, stuburo ir periferinės nervų sistemos ligomis, išsėtine skleroze, Parkinsono liga, epilepsija, vestibulinio aparato ir kitomis neurologinėmis ligomis.
Skyriaus tel. (8 46) 491113

Diagnostikos skyriuje gydomi žmonės, sergantys plaučių, virškinimo sistemos, sąnarių ir kaulų – raumenų ligomis, taip pat ligoniai kuriems neaiški pirminė ligos diagnozė, arba ją reikia galutinai patvirtinti.
Skyriaus tel. (8 46) 491109

Klaipėdos jūrininkų ligoninės Onkohematologijos skyrius – vienas iš trijų specializuotų kraujo ligomis sergančių žmonių gydymo centrų šalyje ir vienintelis Vakarų Lietuvoje. Jame naujausiais metodais bei priemonėmis gydomi įvairiomis kraujo ligomis ir krešėjimo sutrikimais sergantys žmonės.
Skyriaus tel. (8 46) 491100.

Klaipėdos jūrininkų ligoninės nefrologijos skyriuje gydomi pacientai dėl ūminio nefritinio sindromo, kartotinės ir pastovios hematurijos, nefrozinio, izoliuoto šlapimo sindromo, įvairių glomerlų pažeidimų, ūminio inkstų nepakankamumo, inksto išemijos arba infarkto, cistinės inkstų ligos, Alporto sindromo, hipertenzinės inkstų ligos, inkstų venos embolijos ir trombozės, šlapimo nelaikymo ir kitų ligų.
Skyriaus tel. (8 46) 491097 ; Dializių poskyrio tel. (8 46) 491087

Skyriuje reabilituojami pacientai po išeminių, hemoraginių insultų, sergantieji degeneracinėmis (Parkinsono liga, išsėtinė sklerozė ir tt.) ir kitomis nervų sistemos ligomis, po stuburo ir sąnarių pažeidimų, sunkių galvos traumų, po auglio pašalinimo operacijų, taip pat po miokardo infarkto ir širdies operacijų.
Skyriaus tel.: (8 46) 491094; vandens procedūros (8 46) 491096

Palangoje esančiame skyriuje dėl įvairiausių ligų ar jų paūmėjimų per metus gydosi ne tik palangiškiai, bet ir žmonės iš įvairiausių šalies vietovių. Čia patenka netikėtai sunegalavę poilsiautojai, reabilitacijos centrų pacientai, kuriems pablogėja sveikatos būklė. Per metus Bendrosios terapijos skyriuje gydosi apie 1600 pacientų. Skyriaus tel. nr.  (8 460) 41262.

Palangoje esančiame Medicininės slaugos ir palaikomojo gydymo skyriuje teikiamos ir paliatyviosios medicinos paslaugos. Į šį skyrių patenka ypač sunkūs ligoniai, kurių gydymas ir priežiūra čia gali tęstis iki 120 dienų. Kasmet šiame skyriuje  gydoma apie 400 pacientų. Skyriaus tel. nr. (8 460) 30533.